Innosuisse vs. EU Horizon EIC: Nationale F&E-Förderung oder europäisches Flaggschiff? (2026)

Innosuisse und EU Horizon EIC Accelerator gehören beide in die Kategorie der nicht dilutiven Startup-Förderung. Doch die Ähnlichkeit endet dort. Innosuisse ist eine Bundesbehörde, die F&E-Kooperationen zwischen Schweizer Unternehmen und Hochschulen finanziert; der EIC Accelerator ist das Spitzenprogramm der EU für marktreife Startups mit internationaler Skalierungsperspektive. Wer versteht, was jedes Programm wirklich finanziert und welche Voraussetzungen es stellt, kann die richtige Reihenfolge planen.

Auf einen Blick: Innosuisse vs. EIC Accelerator

Innosuisse: Der F&E-Förderer mit Hochschulverankerung

Innosuisse (Schweizerische Agentur für Innovationsförderung) ist eine öffentlich-rechtliche Anstalt des Bundes. Sie vergibt ausschliesslich nicht rückzahlbare Fördergelder; kein Startup gibt Anteile ab.

Die drei Instrumente:

Innovationsprojekte (CHF 50'000 bis CHF 2 Mio.+): Das Kernprogramm verbindet ein Schweizer Unternehmen mit einer akkreditierten Hochschule (ETH Zürich, EPFL, alle kantonalen Universitäten, Fachhochschulen, Forschungsinstitute wie Empa, PSI, Eawag). Innosuisse übernimmt bis zu 100% der zertifizierten Hochschulkosten; das Unternehmen trägt seine eigenen Projektkosten als Eigenleistung und behält die Verwertungsrechte.

Innovationsscheck (CHF 15'000): Einmaliger Zuschuss für eine erste Machbarkeitsstudie an einer Schweizer Hochschule. Kein dauerhaftes Kooperationsformat erforderlich, Bearbeitungszeit 4 bis 6 Wochen. Der einfachste Einstieg in die Innosuisse-Welt.

Start-up Coaching (kostenlos): Strukturiertes Begleitprogramm über 12 bis 24 Monate mit zertifizierten Coaches für Hightech-Startups. Themen: Business Development, Markterschliessung, Investorenansprache.

Was Innosuisse auszeichnet:

• Laufende Einreichung für Innovationsprojekte (kein fixer Stichtag)
• Erfolgsquote von ca. 35 bis 40% (deutlich über dem EIC-Niveau)
• Bearbeitungszeit 2 bis 3 Monate statt 6 bis 12
• Antrag auf Deutsch, Französisch, Italienisch oder Englisch möglich
• IP-Verwertungsrechte verbleiben beim Unternehmen

Was Innosuisse nicht leistet:

• Ohne akkreditierten Schweizer Hochschulpartner keine Innovationsprojekte
• Keine Eigenkapitalkomponente (nur Zuschüsse)
• Fördersummen erreichen nicht das Niveau des EIC Accelerators

EIC Accelerator: Das europäische Flaggschiff für Wachstumsphasen

Der Europäische Innovationsrat (EIC) ist das Spitzeninstrument der EU für Deep-Tech-Startups. Der EIC Accelerator richtet sich an einzelne Unternehmen (keine Konsortien) mit technologisch differenzierten Produkten, die auf europäische oder globale Märkte zielen.

Förderhöhe und Struktur:

• Zuschuss: bis EUR 2,5 Mio. (nicht rückzahlbar; für F&E, Prototyping, Markteintritt)
• Eigenkapitalinvestition: optional bis EUR 15 Mio. durch den EIC-Fonds (EIC wird Minderheitsaktionär)
• Blended Finance: Kombination aus Zuschuss und Eigenkapital möglich

Der dreistufige Antragsprozess:

Step 1 (Kurzbewerbung): Online-Formular mit Pitch-Deck (10 Folien), Video-Pitch (3 Minuten) und strukturierten Fragen zu Innovation, Markt und Team. Entscheid in 4 bis 6 Wochen.

Step 2 (Vollantrag): Umfangreiche schriftliche Bewerbung (ca. 30 Seiten auf Englisch) mit Technologiebeschreibung, Marktanalyse und Businessplan. Externe Gutachter. Entscheid in 3 bis 4 Monaten.

Step 3 (Interview): Persönliches Pitch-Interview in Brüssel vor einer interdisziplinären Jury (ca. 30 Minuten Pitch, 30 Minuten Q&A). Dies ist die härteste Selektionsstufe.

Was den EIC Accelerator auszeichnet:

• Höchste verfügbare nicht dilutive Fördersummen in Europa
• Eigenkapitaloption für Startups, die VC-Kapital noch nicht oder ergänzend suchen
• EIC-Community mit Zugang zu europäischen Investoren und Industriepartnern
• Keine Hochschulbindung als Voraussetzung

Was der EIC Accelerator kostet:

• Erfolgsquote unter 5%: erheblicher Zeitaufwand ohne Erfolgsgarantie
• 6 bis 12 Monate vom ersten Antrag bis zum Entscheid
• Antrag auf Englisch, ca. 30 Seiten; professionelle Vorbereitung faktisch notwendig
• Eigenkapitalteil ist dilutiv

Assoziierungsstatus der Schweiz

Die Beteiligung der Schweiz an Horizon Europe ist an die bilateralen Abkommen mit der EU geknüpft und kann sich ändern. Im Rahmen der Bilateralen III wurden neue Grundlagen geschaffen. Vor der Antragsvorbereitung sollte der aktuelle Status des gewünschten EIC-Programms direkt bei Euresearch (euresearch.ch) geprüft werden. Dieser Schritt kostet wenig Zeit und verhindert Fehlinvestitionen in eine Antragsvorbereitung, die aufgrund von Teilnahmebeschränkungen hinfällig wäre.

Wer passt zu welchem Programm?

Innosuisse ist die richtige Wahl, wenn:

• Das Startup einen laufenden F&E-Bedarf hat, der einen Schweizer Hochschulpartner erfordert
• Das Produkt noch in Entwicklung ist und wissenschaftliche Fragen beantwortet werden müssen
• Eine schnellere Bewerbung und höhere Erfolgsquote Priorität haben
• Das Startup primär auf den Schweizer oder europäischen Nahmarkt ausgerichtet ist
• Die Teamgrösse und Ressourcen für einen aufwändigen EIC-Antrag noch fehlen

EIC Accelerator ist die richtige Wahl, wenn:

• Das Startup ein marktreifes oder marktnahes Produkt hat (TRL 5 bis 8)
• Eine klare europäische oder globale Skalierungsperspektive besteht
• Grosse Finanzierungsvolumina benötigt werden, die Innosuisse nicht liefert
• Das Startup keine Hochschulherkunft hat (Innosuisse-Innovationsprojekte wären nicht zugänglich)
• Eine nicht dilutive Alternative zu VC-Kapital für die Wachstumsphase gesucht wird

Innosuisse als Vorbereitung auf den EIC

Ein etabliertes Muster bei Schweizer Deep-Tech-Startups ist die sequenzielle Nutzung beider Programme: Innosuisse finanziert die Forschungsphase, der EIC Accelerator die Markteinführungsphase.

Diese Sequenz hat mehrere Vorteile: Das Startup kommt mit einer nachgewiesenen F&E-Leistung und bereits ausgearbeitetem Technologie-Narrativ in den EIC-Prozess. Innosuisse-Erfahrung signalisiert dem EIC-Gutachter, dass das Projekt wissenschaftlich solide ist. Die Antragsvorbereitung fällt leichter, weil die technische und kommerzielle Dokumentation bereits vorliegt.

Die Rolle von Euresearch

Wer den EIC Accelerator anstrebt, sollte Euresearch frühzeitig einbinden. Euresearch ist die nationale Kontaktstelle der Schweiz für Horizon Europe und bietet kostenlose Dienstleistungen:

• Prüfung des EIC-Antrags (Step 1 und Step 2) vor der Einreichung
• Strukturiertes Feedback zu Technologie-Narrativ, Marktkapitel und Finanzplan
• Partnervermittlung für EU-Konsortialprojekte
• Information über aktuellen Schweizer Assoziierungsstatus
• Regionale Büros in Bern, Zürich, Lausanne, Basel und Lugano

Für Innosuisse-Anträge bietet Innosuisse selbst optionale Vorab-Checks an. Projekte mit Vorab-Check haben eine signifikant höhere Erfolgsquote; dieser Schritt sollte nicht übersprungen werden.

Kombinierbarkeit: Beide Programme parallel möglich

Innosuisse und EIC Accelerator können für unterschiedliche Arbeitspakete gleichzeitig laufen. Die Bedingung: dieselben Kosten dürfen nicht aus beiden Quellen finanziert werden (keine Doppelfinanzierung). Beide Programme verlangen eine transparente Erklärung zu gleichzeitig beantragten oder erhaltenen Drittmitteln. Wer beide Programme parallel betreibt, sollte die Kostenabgrenzung klar dokumentieren und bei der jeweiligen Agentur offenlegen.