Abacus vs. Run my Accounts: Schweizer Buchhaltung im Vergleich (2026)

Abacus und Run my Accounts stehen für zwei fundamental verschiedene Philosophien der Geschäftsbuchhaltung in der Schweiz. Abacus ist das bewährte ERP-System, das seit über 40 Jahren in der Schweiz entwickelt wird und von Maschinenbauunternehmen bis zu grossen Treuhandbüros eingesetzt wird. Run my Accounts dagegen wurde 2011 in Steinhausen ZG gegründet mit einem klaren Fokus: Buchhaltung radikal vereinfachen für Unternehmen, die digital arbeiten. Beide sind vollständig auf das Schweizer Recht ausgerichtet und beide bedienen einen wachsenden Markt. Die Frage ist, welches Modell zu Ihrer Unternehmensrealität passt.

Auf einen Blick: Abacus vs. Run my Accounts

Abacus: bewährtes ERP für komplexe Anforderungen

Das Unternehmens- und Partnernetzwerk

Abacus Business Solutions AG sitzt in Wittenbach SG und beschäftigt mehrere Hundert Mitarbeitende. Das Unternehmen vertreibt ausschliesslich über ein Netz von über 200 zertifizierten Partnern in der Schweiz. Dieser Ansatz hat sich über Jahrzehnte bewährt: Partner kennen die lokalen Branchenanforderungen, können Implementierungen massgeschneidert aufsetzen und bieten langfristige Begleitung. Für wachsende Unternehmen mit komplexen Anforderungen ist das ein echter Vorteil.

Funktionsumfang und Module

Abacus ist modular aufgebaut und kann von einer einfachen Finanzbuchhaltung bis zu einem vollständigen ERP ausgebaut werden. Kernmodule sind Finanzbuchhaltung, Kreditoren/Debitoren und Anlagebuchhaltung. Darüber hinaus gibt es AbaPay für den elektronischen Zahlungsverkehr, AbaProject für Projektkostenrechnung, AbaSalary für die Lohnverarbeitung inklusive AHV und BVG, sowie Module für HR, CRM und Materialwirtschaft.

Das bedeutet: Wenn ein Unternehmen wächst und neue Anforderungen entstehen, müssen keine Daten migriert oder Systeme gewechselt werden. Das zusätzliche Modul wird einfach beim bestehenden Abacus-Partner dazulizenziert und konfiguriert.

Schweizer Compliance auf höchstem Niveau

Abacus gilt als eine der tiefsten Schweizer Compliance-Lösungen im Markt. MWST nach Effektiv- und Saldosteuermethode, AHV/IV/EO-Abrechnungen, BVG-Meldungen, Quellensteuer, Lohnausweise und Swiss GAAP FER-Abschlüsse sind vollständig integriert. Gesetzliche Änderungen werden über reguläre Updates eingespielt; Partner informieren ihre Kunden proaktiv bei relevanten Anpassungen.

Schwächen im Vergleich zu Run my Accounts

Für digitale Unternehmen ist der wichtigste Nachteil von Abacus der Implementierungsaufwand. Eine Abacus-Installation erfordert einen zertifizierten Partner, eine strukturierte Einführung und typischerweise mehrere Wochen Vorlaufzeit. Direkte API-Verbindungen zu Shopify, WooCommerce oder Stripe sind nicht nativ vorhanden; sie müssen separat konfiguriert werden, was zusätzliche Projektzeit und Kosten bedeutet. Für Unternehmen, deren Kerngeschäft online läuft, ist das eine erhebliche Hürde.

Run my Accounts: Cloud-first Buchhaltung für digitale Unternehmen

Gründungsidee und Positionierung

Run my Accounts AG wurde 2011 in Steinhausen ZG gegründet mit dem Ziel, Buchhaltung für Unternehmen mit digitalem Geschäftsmodell zu vereinfachen. Die Plattform wurde von Anfang an als reine Cloud-Lösung entwickelt, ohne Altlasten aus der Desktop-Ära. Das merkt man: Updates erfolgen automatisch, neue Integrationen werden rollierend ausgerollt, und die Benutzeroberfläche ist auf Geschwindigkeit und einfache Handhabung ausgelegt.

Stärke: E-Commerce-Integrationen

Das grösste Differenzierungsmerkmal von Run my Accounts gegenüber Abacus sind die nativen Integrationen zu E-Commerce- und Zahlungsplattformen. Shopify, WooCommerce, Stripe, SumUp, TWINT und weitere sind direkt angebunden. Zahlungseingänge werden automatisch verbucht, Rechnungen automatisch erzeugt, und Belege per App hochgeladen. Für Unternehmen mit vielen täglichen Transaktionen reduziert das den manuellen Buchhaltungsaufwand erheblich.

Automatisiertes Belege-Matching

Run my Accounts arbeitet mit einem Algorithmus, der Bankbelege mit offenen Posten abgleicht. Kontoauszüge der wichtigsten Schweizer Banken (PostFinance, UBS, ZKB, Raiffeisen, BEKB, Valiant und weitere) werden direkt importiert; Buchungen werden vorgeschlagen und können mit einem Klick bestätigt werden. Das ist für Unternehmen mit hohem Transaktionsvolumen erheblich effizienter als manuelle Buchführung.

Optionaler Buchführungsservice

Ein oft übersehenes Merkmal von Run my Accounts ist der optionale Buchführungsservice: Unternehmen, die ihre Buchhaltung nicht selbst führen wollen, können direkt über Run my Accounts ein internes Buchführungsteam buchen. Dieses Team übernimmt die laufende Verbuchung auf Basis der hochgeladenen Belege. Das macht die Lösung besonders attraktiv für Gründerinnen und Gründer, die sich vollständig auf ihr Kerngeschäft konzentrieren wollen.

Grenzen von Run my Accounts

Run my Accounts ist auf Buchhaltung und Liquiditätsmanagement fokussiert. Eine vollständige Lohnbuchhaltung für grössere Teams, Projektkostenrechnung, Anlagebuchhaltung und HR-Management sind nicht Teil der Kernlösung. Für Unternehmen, die diese Funktionen benötigen, müssen separate Tools eingesetzt werden, was die Integrationsarchitektur komplexer macht.

Integration, Schnittstellen und Bankanbindung

Beide Systeme unterstützen den Schweizer Standard für elektronischen Zahlungsverkehr (ISO 20022, camt-Format). Der Unterschied liegt in der Integrationsbreite: Abacus kann über seinen Partnern mit nahezu jedem Drittsystem verbunden werden, erfordert aber jeweils Konfigurationsaufwand. Run my Accounts hat diese Integrationen für die häufigsten Anwendungsfälle bereits fertig gebaut.

Für Unternehmen, die bestehende Systeme (Warenwirtschaft, POS, E-Commerce) nahtlos mit der Buchhaltung verbinden wollen, ist Run my Accounts bei gängigen Plattformen klar effizienter. Bei branchenspezifischen oder proprietären Drittsystemen hat Abacus mit seinem flexiblen Integrationsrahmen die Nase vorn.

Kosten im Detail

Die Kostenstruktur unterscheidet sich grundlegend. Run my Accounts bietet transparente monatliche Abonnements: Einstiegspläne für kleine Unternehmen starten bei etwa CHF 49/Monat, umfangreichere Pläne mit mehr Transaktionen und Funktionen bei CHF 99 bis CHF 199/Monat. Der optionale Buchführungsservice wird zusätzlich verrechnet, ist aber verglichen mit externen Treuhändern oft konkurrenzfähig.

Abacus hat keine öffentliche Preisliste. Die Kosten setzen sich aus Partnerhonoraren für die Implementierung (typischerweise CHF 150 bis CHF 250 pro Stunde), Softwarelizenzen und jährlichen Wartungsgebühren zusammen. Kleine Installationen starten ab CHF 3'000 bis CHF 5'000 für Einrichtung und erste Lizenzen; grössere ERP-Deployments mit mehreren Modulen und Nutzern können CHF 20'000 bis über CHF 50'000 kosten. Diese Investition amortisiert sich über Jahre, ist aber für kleine Unternehmen ohne ERP-Bedarf unverhältnismässig.

Support, Updates und Betrieb

Run my Accounts aktualisiert die Plattform automatisch und kontinuierlich. Nutzer müssen keine Updates planen oder installieren. Der Support erfolgt via E-Mail, Chat und eine umfangreiche Online-Wissensdatenbank. Da es sich um SaaS handelt, werden Fehler und Schwachstellen zentral behoben, ohne dass Kunden aktiv werden müssen.

Abacus-Updates werden vom Partner eingespielt und getestet, bevor sie in der Produktivumgebung aktiviert werden. Das bietet mehr Kontrolle, erfordert aber aktive Abstimmung mit dem Partner und gelegentliche Update-Projekte. Für grosse Unternehmen, die Stabilität über Aktualität stellen, ist das ein Vorteil. Für kleine Teams, die sich nicht mit Softwarepflege beschäftigen wollen, ist es ein Nachteil.

Typische Anwendungsszenarien

Abacus ist die richtige Wahl für: Ein produzierendes Unternehmen mit 30 Mitarbeitenden, das Lohnbuchhaltung, Projektkostenrechnung und Finanzbuchhaltung aus einer Hand benötigt und einen langfristigen ERP-Partner aufbauen möchte. Oder ein wachsendes KMU, das heute mit Buchhaltung startet und in zwei Jahren HR und CRM integrieren will, ohne die Plattform zu wechseln.

Run my Accounts ist die richtige Wahl für: Ein E-Commerce-Startup, das täglich Hunderte von Shopify-Bestellungen und Stripe-Zahlungen verbuchen muss und dafür keine manuelle Dateneingabe leisten kann. Oder ein SaaS-Unternehmen mit internationalen Kunden, das schlanke Cloud-Tools bevorzugt und seinen Treuhänder direkt über die Plattform einbinden möchte.

Wann eignet sich welche Lösung?

Abacus wählen, wenn:

• Sie ein wachsendes KMU mit 15 oder mehr Mitarbeitenden führen
• Sie Lohnbuchhaltung, HR und weitere Module aus einer Hand wollen
• Ihr Treuhänder oder IT-Partner Abacus-zertifiziert ist
• Sie eine langfristige ERP-Infrastruktur aufbauen, die mit dem Unternehmen wächst
• Branchenspezifische Anforderungen (Bau, Produktion, Projektgeschäft) eine tiefe ERP-Integration erfordern

Run my Accounts wählen, wenn:

• Sie einen Online-Shop betreiben oder digitale Produkte und Dienstleistungen verkaufen
• Sie E-Commerce-Plattformen und Zahlungsdienste automatisch mit der Buchhaltung verbinden wollen
• Sie sofort starten wollen ohne Partner-Suche und Implementierungsprojekt
• Ihr Team keine Buchhaltungsexpertise hat und ein maximal einfaches System bevorzugt
• Sie den optionalen Buchführungsservice als Ergänzung oder Ersatz eines externen Treuhänders nutzen wollen

Fazit

Abacus und Run my Accounts treffen unterschiedliche Unternehmen zu unterschiedlichen Momenten ihrer Entwicklung. Run my Accounts ist für digitale Geschäftsmodelle, die schnell starten und automatisiert arbeiten wollen, die überzeugendere Lösung. Abacus ist für Unternehmen, die eine skalierbare ERP-Plattform mit tiefster Schweizer Compliance und einem langfristigen Partner aufbauen wollen, die richtigere Wahl. Wer heute mit Run my Accounts startet, kann zu einem späteren Zeitpunkt zu Abacus wechseln, wenn die Komplexität es rechtfertigt.